配合中央流行疫情指揮中心宣布第三級警戒延長至6月14日、臺北市政府有關新冠肺炎防疫政策，本會自5月15日起暫停對外界開放凱達格蘭文化館、北原會館及娜魯灣創藝會所等3處公有場館；本會委外之原民風味館，因應疫情委外廠商亦於5月18日起休館停止營業1個月。隨著場館暫時停止開放，場館內本會多項服務也隨之暫停或調整，待疫情指揮中心解除後再行開放（見下表）。
活動部份：5月28日辦理之藝文特展開展記者會延期辦理；6月5日辦理藝文起飛甄選活動為因應防疫措施，延期辦理。花博農民市集自即日起暫停。原定5月29日-30日與秀林鄉公所合作案，延至6月底再行評估辦理。原樂好市原定5月17日辦理之攤商說明會改採線上諮詢方式辦理。
課程部份：包括臺北市部落大學、原住民族合唱團、語言巢自即日起，暫停相關課程。
族人服務提供部份，本會耆老服務中心4據點（北原會館、娜魯灣創藝會所、凱達格蘭文化館及興隆區民活動中心）即日起暫停服務，但持續進行關懷問安服務。兒少關懷服務方案各行政區課後照顧課程據點或活動持續暫停服務；長青樂活服務方案自即日起，暫停所有外展服務（文化傳講），並停止相關教育訓練、研習及講座課程。
原民會巴干•巴萬主任委員表示，因疫情出現社區不明本土感染案例，為確保族人健康安全，各項活動、服務、課程需要視疫情調整，但是各行政區原服員對於族人的各項關懷持續進行，補助業務等服務不打烊，呼籲大家共同配合防疫措施，共度難關。
臺北市原民會因應疫情調整措施一覽表(5月26日更新)
| 類型 | 實施項目 | 措施 | 備註 |
| 場館 | 北原會館 凱達格蘭文化館 娜魯灣創藝會所 |
5月15日起暫停開放 |
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| 場館 | 原民風味館 | 5月18日起停止營業1個月。 | 委外場館 |
| 場租 | 花博公園迎客坊 | 5月12日起暫停租借 | |
| 活動 | 藝文特展 | 5月28日開展記者會延後 | |
| 活動 | 藝文起飛 | 6月5日辦理甄選活動暫停舉行 | |
| 活動 | 花博農民市集 | 自即日起至暫停 | |
| 活動 | 秀林鄉公所合作案 | 5月29至30日展攤活動延後 | |
| 活動 | 原樂好市 | 5月17日攤商說明會改為線上諮詢方式辦理 | |
| 課程 | 臺北市原住民族合唱團、部落大學、語言巢 | 自即日起暫停所有課程 | |
| 服務 | 耆老服務中心 | 暫停所有據點服務 | 持續進行關懷問安服務 |
| 服務 | 兒少關懷服務方案 |
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| 服務 | 長青樂活服務方案 |
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