今日臺灣受颱風北上、鋒面接近及午後熱力作用影響，北市境內出現範圍廣且強度集中的短延時暴雨。柯文哲也於疫情記者會開始之前，向市民說明北市府因應0604午後強降雨的災害應變即時作為。
柯文哲表示，昨（3）日環保局已預先加強水溝清理，今日上午各局處都預做強降雨事前準備。午後雨勢持續加強，北市府於13時57分開設二級災害應變中心，14時24分提升為一級。目前由蔡炳坤副市長及本府各局處代表，於0604午後強降雨一級災害應變中心持續針對北市各區災情做即時處置。
截至疫情記者會開始前，14時50分回報資料如下：
一、北市大安、文山、南港、內湖、信義等區時雨量超過100毫米以上，部分行政區時雨量甚至超過200毫米以上。
二、市府接獲災情通報達274件，260件均為積淹水災情，尚未有人員傷亡情形。
三、信義車行地下道和南深路閘門，均已關閉禁止通行
柯文哲指出，北市排水設計建造標準為每小時78毫米，一旦時雨量超過78毫米就有淹水可能，不過只要沒有持續性降雨，雨停後就會迅速排乾。他也提醒市民，未來仍可能發生間歇性強降雨，如有後續的降雨致災，請市民即時通報市府處理。
隨後，柯文哲向市民報告最新疫情狀況。依據今（4）日中央疫情指揮中心公布全國本土新增及校正回歸個案共472例（其中北市個案佔152例），另全國新增21例死亡個案，並有2例境外移入個案。
柯文哲也公布萬華專案快篩數據，昨日完成609人快篩，陽性率較前（2）日稍降，為4.4%。他表示，如以萬華專案的每日快篩陽性數，再對照12行政區近六週確診案例數據，可看出北市疫情趨勢雖獲控制，但未全面撲滅，潛在感染源已散佈至北市各區。
因此，柯文哲呼籲北市市民及全臺民眾調整心態，未來大家身邊隨時都有可能出現感染案例，千萬不可鬆懈。他也認為，短期內三級警戒應無法解除，但北市府會努力，在盡量不影響民生經濟的前提下，維持住防疫管制效果，讓市民平安地撐到施打疫苗。
北市府不斷將醫療收治量能擴充。柯文哲表示，截至昨日北市可收治COVID-19個案的病床合計已達1363床，今天預計能再升到1370床。他相當感謝各大醫院以及各界協助，讓病床數能順利到位，近日北市消防車已無發生到院卻無法收住之情形。
除病床數持續增加之外，柯文哲也指出，北市防疫旅館床數量能同樣足夠，目前達1800床。且已建置線上登錄系統，即時掌握防疫旅館空床數。在量能充足的前提下，未來北市確診個案原則會優先送往加強版專責防疫旅館或醫院，減低家戶傳染風險。
在北市相關病房及防疫旅館床數都足夠的狀態下，柯文哲提出「北市區域聯防架構」。目前北市12行政區都已建立防疫旅館及醫院之間的聯防架構，彼此配對、即時聯繫，只要有需要都可以將個案從防疫旅館，轉送至該區相對應的醫院。
柯文哲強調，防疫不分你我，未來將朝向雙北市醫療資源串連，並以中央資源當作 buffer（緩衝）。他表示，北市將運用自有量能、做最有效率調度，甚至以後新北市個案也可以到北市加強版防疫專責旅館收住。至於在北市境內及周邊的中央集中檢疫所的量能，就交還給中央去自行調配，如此一來中央有餘裕可調度，支援新北市的個案需求。
柯文哲也重申北市府的疫苗大型施打規劃，由於不同疫苗仍有相關的副作用、甚至是併發症，因此接種點原則上仍以第一線醫院為主，再來才會考慮二三線等大型施打點，也會提供機動接種，服務特殊需求族群。
柯文哲表示，北市將配合中央屆時配發給北市的疫苗數及配送期程，盡快讓相關類別市民接種。他也說，希望中央規劃的疫苗接種預約平臺能盡快上線，降低北市及全國民眾在疫苗接種點發生排隊群聚。
除此之外，為了讓採檢系統的確診數字出爐更快速且精確，市府已努力降低快篩偽陽率，目前已達80%的準確度，讓市府更能爭取時間，研判疫情趨勢、研擬最新防疫政策。
會後進行媒體聯訪。首先，有媒體問到，北市聯醫不少醫護染疫，卻聲稱感染源全在院外，臺北市立聯合醫院企業工會在Facebook發文，舉了幾個明顯病患傳染給同仁，或同事間傳染的案例，批評聯醫只是想撇清雇主責任，把醫護染疫推託在員工自身或院外，請問實際情況為何？對此，臺北市立聯合醫院副總院長璩大成表示，既然在公家醫院，雇主跟僱員身份經常可以轉換，在聯醫大家都不分彼此、將心比心，但若在過程中有造成任何人不愉快或不悅的感覺，聯合醫院要對此致歉。但他強調，聯醫有專業的團隊在分析疫情，他給予高度信任，目前不管院內跟院外感染，最常見的狀況都是在脫除隔離衣的過程中感染，因此他呼籲要確實落實相關SOP，他也再次感謝在第一線工作的醫護人員。
媒體詢問，市長日前表示確診死亡數一定會校正回歸，認為很多數字都還沒加上去，而今日死亡人數似乎又創新高，中央每日都會公布當日確診數，但先前曾宣布不再公布的校正回歸，卻依舊每日宣布，篩檢的時間落差還是無法補上嗎？是否也干擾目前北市疫情判讀？對此，柯文哲表示，校正回歸是因為PCR檢測的時間落差關係，他知道這個問題目前還是無法解決，因此北市先利用快篩的方法；但他知道中央必須要求精確，那就快不起來，短期內還是會有校正回歸的問題。
媒體詢問，據了解，北市府規劃優先讓機動快篩隊去萬華區市場做快篩，計畫從什麼時候開始？打算試辦哪些市場？副市長黃珊珊說明，萬華有許多大型的傳統市場，目前正在造冊，造冊完畢就會去做快篩。
媒體詢問，前立委陳宜民呼籲市長讓國產疫苗三期試驗在雙北可以先做，市長怎麼看?臺北市民會變成白老鼠?柯文哲表示，國產疫苗要符合國際認證，該做的還是要做，交給專業；北市府會在保護市民安全的前提下提供最大協助。
多家媒體詢問，市長之前指出疫情陷入膠著，今天日本贈送的124萬劑疫苗來台，能解決臺疫苗問題嗎？一下傳出賴副總統求援日本前首相安倍晉三，一下又傳出蔡總統幕後做決策，怎麼看這樣消息?中央是否有找各縣市討論疫苗分配數？這些疫苗能讓臺灣撐多久？對此，柯文哲強調，在三級疫情之下，他說過，有認證且價錢不要太離譜的疫苗，能打就先打；日本政府也不會做出違反國民意志的事情，過去臺灣是對日本311大地震捐款最多的國家，不管是兩國政府或民間關係都相當良好，因此日本給臺灣疫苗是個好例子。至於民進黨立委鄭運鵬、臺南縣長黃偉哲呼籲讓日僑先打此批疫苗，柯文哲則回應，這也是合情理的事情。
媒體詢問，有民眾砲轟，疫苗都來自美日，以後乾脆叫美日代購疫苗就好了，要臺灣政府做什麼？同時，中國國台辦也搶著要給臺灣疫苗，強調「充足高效也都有國際認證」，市長覺得哪一國給的比較好？臺灣是否該接受？柯文哲強調，不管哪一國疫苗，都要由中央政府去統籌，疫苗趕快發下來去打比較重要，把疫苗當作圍堵疫情重要工具，現在疫情還緊急，沒有心情打口水戰。
媒體詢問，公投護台灣聯盟促進會總召蔡丁貴，3號在臉書呼籲，台灣人應參與國產新冠疫苗第三期臨床實驗，但本人卻已在美國打過2劑輝瑞新冠疫苗，引起爭議。網友翻出市長2年前說「搞臺獨的兒子孫子都躲在美國、紐西蘭，就騙子啊！」，大讚你是先知，怎麼看？以及臺灣人到底是否應該大舉參與國產疫苗的三期臨床實驗？柯文哲說，現在沒有心情打口水戰，三期實驗該怎麼就怎麼做，回歸專業，至於口水戰以後再處理。
媒體詢問，美國宣布提供亞太地區700萬劑疫苗，包括臺灣在內15個國家與地區可以獲得疫苗，但是前AIT處長酈英傑認為臺灣確診率還不高，市長會不會擔心700萬劑疫苗大多分配給印度等疫情研嚴重地區，臺灣能拿到的疫苗有限?柯文哲認為，每個國家有其立場，人家若有送我們，我們都說謝謝，也不要有不切實際的期望，很多亞洲國家人口數都比我們多，我們只能拿多少疫苗做多少事。
媒體詢問，專家建議封城三周，換打疫苗時間，北市會考慮嗎?確診數字沒下降，死亡數還增加，市長認為染疫高峰期過了嗎?柯文哲指出，新冠肺炎從感染到死亡的時程差不多要三個星期，所以會有時間差的問題，因此死亡數不是估計疫情嚴重與否的有效參數。至於封城這件事，他思考很久，有疫苗打的話就不用封城，沒疫苗打的話，或許封城也沒用，因為可能撐不了那麼久。他認為，在目前維持三級管制的策略下，先以最低的行政成本，撐到疫苗可以打的那天，這或許是最佳的戰略。
媒體詢問，北市府發出「健康關懷天使，離退人員召集令」，有許多護理人員響應，但有人反應，兩個月之後才能領到薪水，而且有人還沒有勞健保，是否可能讓所有支援的人都有勞健保，早一點拿到薪水？黃珊珊對此回應，勞健保的部分，市長已經指示全部都會有，薪水的問題，她會盡快去了解情況。
媒體詢問，早上有議員捐2000件防護衣給臺北市醫護，其中有提到N95口罩目前也很缺乏，請問北市是否有盤點防疫物資的量?目前還有什麼項目較缺乏?黃珊珊說，目前物資都是足夠的，會有一些缺口，是因為短時間增加太多防疫人員（防疫旅館人員、醫護人員、防疫計程車人員），目前都是由衛生局備援系統提供物資，許多捐贈的善款也開始去購置物資。
媒體詢問，因應疫情，中央紓困計畫4日開跑，請問臺北市民符合紓困補助人數有多少?市府社會局及各單位會如何協助民眾盡速領到紓困補助金?臺北市目前收到的捐款數有多少，是否已經開始執行使用，是否也會用到紓困?黃珊珊進一步指出，通過中央109年的紓困案不用申請，只要衛福部跟區公所核定後，
媒體詢問，近日雨勢滂沱，快篩站很多是戶外的，目前北市府有無雨備因應計畫？黃珊珊表示，市府已經做過相關的討論跟準備，今天的快篩站開到下午四點，明天因為颱風暫停一天，未來會視情況隨時修正快篩站的開設情況。
媒體詢問，指揮中心建議地方政府應該要建立「Call Center（呼叫中心）」，陳宗彥說這是為了迅速確實掌握確診者的足跡跟接觸的對象，北市怎麼看？柯文哲表示，目前北市的醫院跟專責旅館的容量足夠，因此確診者主要移到這兩處，待在家裡的比較少；呼叫中心主要是處理疫調，上批召募的醫護人員沒有錄取的，若可以做電話關懷，再請他們組隊。
媒體詢問，現在雙北疫情還是嚴峻，市長是否認為應該強制民眾都來普篩?還是有什麼具體辦法?柯文哲說，普篩還是有偽陽偽陰的問題，所以在疫情達到一定盛行率再做；他也呼籲民眾這週末不要外出群聚，也不要在家裡開趴、打麻將，增加群聚危險。
媒體詢問，目前6月14日要解除三級是否相當困難？尤其新一波群聚在苗栗爆發，市長怎麼看？柯文哲說，要解除三級不太容易，像日本就曾三次緊急事態宣言，其中還有兩次延長；重點還是看疫苗可以多快來，國產疫苗則是該怎麼做就怎麼做，但要如期解封真的不容易。
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