北市衛生局於105年2月即與臺大公衛學院及臺大醫院簽訂合作協議，與公衛學院合作利用GIS分析大量毒品查獲地點之資料，透過視覺化歸納，配合熱點分析繪製風險圖像，有助於辨識三、四級毒品之聚集地點，建立藥物濫用資料GIS分析模式，供各地毒品危害防制中心參考運用，並將研究成果發表於台灣公共衛生雜誌。還有新型海洛因檢測標的之檢測研究，從美沙冬病人尿液檢體中，發現海洛因不純物一系列之代謝物，可做為是否使用非法海洛因的依據，可降低偽陽性產生。
此外，與臺大醫院的合作案，有結核病防治及大腸癌檢查涵蓋率初探，臺大醫院自105年起加入臺北市潛伏結合感染(LTBI)指定治療醫院，整合了胸腔內科、感染科及小兒感染科之相關專科醫師約30多位，共同努力執行結核病高風險個案篩檢及治療，以提升結核病防治品質。另外，大腸癌檢查涵蓋率分析目前仍持續合作執行中，就臺北市立聯合醫院暨所屬院外門診部所執行大腸癌篩檢結果進行分析。經過前幾年合作經驗，藉由學術及臨床所提供的研究結果及實務經驗，提供衛生政策參考，讓官學合作發揮最大效益。
近年來持續面臨衛生議題不斷，包括萊豬、COVID-19疫情、人口結構快速老化等眾多公共衛生議題挑戰及威脅，凸顯衛生議題與民眾生活息息相關，為制訂更完善之衛生政策，打造永續宜居的健康城市。因此，北市衛生局為延續理論與實務結合之良好合作模式，共同解決公衛問題，續與臺大公衛學院及臺大醫院簽署合作協議/意向書。
衛生局黃世傑局長提出未來5年合作方向，包含食品安全、長照資源評估、毒品危害防制、雙向轉診、醫療結合保險科技及失智共照中心等領域議題，期望藉由三方合作同心，共同打造市民健康福音。
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